Japan je ostrvska zemlja i proteže se duž istočne (pacifičke) obale Azije. Glavna ostrva od sjevera prema jugu su Hokkaido, Honshu, Shikoku i Kyushu. Osim njih, Japanski arhipelag obuhvata oko 3000 manjih ostrva.
Površina: 377.835 km˛ (uključujući 3.091 km˛ teritorijalnih voda)
Obala: 29.751 km
Najviši vrh: planina Fuji (3.776 m)
Najniža tačka: Hachiro-gata (-4 m)
Oko 73% zemlje je brdovito, s planinskim lancem koji se proteže preko
glavnih ostrva.Kako je malo ravnica, mnoga brda i planinski obronci se
obrađuju sve do vrha, a na svakoj većoj ravnici su se razvili važniji
gradovi.Japan se nalazi u vulkanskoj zoni na Pacifičkom vatrenom krugu.
Duž svih ostrva se osjećaju česta slaba podrhtavanja tla i povremene
vulkanske aktivnosti.Razorni zemljotresi, čiji rezultat su često
tsunamiji, događaju se nekoliko puta u sto godina. Najveći zemljotresi u
zadnje vrijeme bili su Chuetsu 2004. godine i Veliki Hanshin potres
1955. godine. Mnogo je toplih izvora, koje su razvili u odmarališta
